Marmaray, İstanbul'un iki yakasını birbirine bağlayan bir raylı sistemdir. Koçak Pansiyon'un bulunduğu Yenikapı İstasyonu, Marmaray'ın Avrupa Yakası'ndaki en önemli duraklarından biridir. Marmaray ile Kadıköy, Üsküdar, Beşiktaş, Levent, Bakırköy, Zeytinburnu gibi şehir merkezinin birçok noktasına ulaşabilirsiniz.

Yenikapı Metro İstasyonu, M1A (Yenikapı - Atatürk Havalimanı) ve M1B (Yenikapı - Kirazlı) metro hatlarının kesiştiği bir istasyondur. Bu hatlarla Fatih, Zeytinburnu, Ataşehir, Esenyurt gibi ilçelere ulaşabilirsiniz.

Yenikapı Tramvay İstasyonu, T1 (Kabataş - Bağcılar) tramvay hattının son durağıdır. Bu hatla Kabataş, Eminönü, Aksaray, Bağcılar gibi bölgelere ulaşabilirsiniz.

Yenikapı Şehirlerarası Deniz Otobüsü (İDO) İskelesi, İstanbul'un ana deniz otobüsü terminallerinden biridir. Bu iskeleden, Marmara Denizi'ndeki birçok il ve ilçeye deniz otobüsü ile ulaşabilirsiniz.